由美国康奈尔大学主导的一项新研究发现:一种被广泛研究的蠕虫——秀丽隐杆线虫的基因组存在缺陷。现在,科学家们创造了一个新的蠕虫基因组序列,这将为未来的研究奠定基础并提高准确性。相关论文近日发表在《基因组研究》杂志上。

作为研究的一部分,研究人员将VC2010与原始N2基因组进行了比较。他们原以为会有一场近乎完美的匹配,但结果却出乎意料。Schwarz说:“除了我们预计会看到的1亿个核苷酸,我们还发现了另外200万个核苷酸,也就是基因组的另外2%。”

其他实验室已经开始使用现代测序工具来重新评估其他基因组,这对合成生物学也有意义。在合成生物学中,科学家正在从零开始创造生命。“拥有一个非常好的DNA序列是一个重要的基线。”
Schwarz说。

Schwarz补充说,在包括人类在内的其他生物体的标准基因组中也可能出现类似的问题。他说:“这向我们表明,拥有真正完整的动物DNA并不像我们想象的那么容易。”

秀丽隐杆线虫是是第一个进行基因组测序的多细胞真核生物,它们易于生长,没有骨骼、心脏或循环系统。同时,它与人类共享许多基因和分子通路,这使其成为研究基因功能、药物治疗、衰老以及癌症和糖尿病等人类疾病的重要模型。

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编译:花花

秀丽隐杆线虫的遗传学研究基于一种名为N2的单一品系,然而尽管人们试图坚持一个共同的标准,但个别实验室自己培养了N2蠕虫品系,这就导致了变异。通讯作者、分子生物学和遗传学系助理研究教授Erich
Schwarz解释说:“过去10年,随着高水平DNA测序技术在更先进的基因实验中的使用,科学家们震惊地发现,40多年来出现了许多不同的N2品系,我们不能指望用这其中的任何一个品系做实验。”

这项新研究描述了一种名为VC2010的遗传背景清晰的单一蠕虫品系,其中的每个个体都完全相同。来自东京大学、斯坦福大学、英属哥伦比亚大学和明尼苏达大学的Schwarz等人使用尖端技术对VC2010的基因组进行测序,并创建了一个新的标准。

图中展示了秀丽隐杆线虫的三个生命阶段:一个雌雄同体的成虫,一个较小的幼虫,以及11个新产下的卵
。成虫大约有1毫米长。